创新与创业服务协会管理机制健全，具备完整的组织架构以及明确的《创新与创业服务协会章程》，能够按照《章程》独立自主开展工作。
协会现有成员80人。下设办公室组、活动策划组、设计组、网络与新媒体组、团队创业组、竞赛领航组6个小组。其中设置协会会长3名（1正2副），组长12名（每小组2名），负责全面统筹协会各项工作，带领各组分工配合开展相关创新创业实践活动。
各组具体分工如下：
1.办公室组
（1）主要负责协会日常行政工作及协调各组间工作安排，传达最新工作信息；
（2）负责管理协会排班值班、会议、记录等内务工作；
（3）协助创新创业学院进行物资整理、归档、购置；
（4）协助会长拟定章程和制度，并督促各项规章制度的落实与实施；
（5）负责协会成员信息的收集、整理、保管，建立工作人员管理制度。
2.活动策划组
（1）负责协助创新创业学院筹划、组织、实施校内各类赛事、讲座、沙龙；
（2）负责筹划创新创业学院素拓活动、生日会、节日晚会等各类学生活动，提升协会成员及创业团队凝聚力。
3.设计组
（1）负责制作协会活动海报、视频、宣传册等宣传资料；
（2）负责协会日常各项设计工作并为协会成员、入驻创业团队提供设计支持；
（3）负责创新创业学院活动摄影工作。
4.网络与新媒体组
（1）负责运营“创始者俱乐部”“广州软件学院创新创业学院”官方微信公众号、创新创业学院官方网站、今日头条等新媒体平台，进行定期资讯排版编辑及推送；
（2）负责各类活动新闻稿的撰写、排版，活动嘉宾、两创入孵团队的采访，撰写相关创新创业类新媒体文案；
（3）负责采集优质创新创业推文，并进行推送。
5.团队创业组
（1）负责协助创新创业学院进行项目团队的日常管理与沟通服务工作；
（2）对接活动策划组定期举办创业团队讲座、沙龙、培训等活动。
6.竞赛领航组
（1）负责各类赛事跟踪；
（2）为创新创业学院入孵项目团队提供技术支持；
（3）面向全体协会工作人员提供技术培训。